Die deutsche Zollverwaltung - oder einfach nur: der Zoll - ist dreistufig organisiert. Oberste Bundesbehörde ist das Bundesministerium der Finanzen. Mittelbehörden sind die Bundesfinanzdirektionen und das Zollkriminalamt. Diese nehmen eine Brückenfunktion zwischen dem Bundesfinanzministerium und den nachgeordneten örtlichen Dienststellen wahr (Hauptzollämter, Zollämter, und Zollfahndungsämter) und unterstützen die Ortsbehörden.

Der Aufgaben- und Tätigkeitsbereich des Zolls hat sich im Verlauf der letzten Jahrzehnte entscheidend verändert. Aus einer Verwaltung, deren Aufgabe hauptsächlich in der Grenzabfertigung bestand, ist eine moderne Wirtschaftsverwaltung des Bundes geworden, deren Tätigkeitsspektrum sich von der reinen Dienstleistung bis zum präventiven hoheitlichen Handeln erstreckt.